Epitranskripcijski vplivi na mišično maso in moč: Proučevanje krožne RNA v mišičnem tkivu starejših odraslih / Epitranscriptional influences on muscle mass and strength: Exploring circular RNA in muscle tissue of older adults
natisniPredstavitev projekta
Naslov: Epitranskripcijski vplivi na mišično maso in moč: Proučevanje krožne RNA v mišičnem tkivu starejših odraslih
Acronim: circExplore
Vodja projekta: Felicita Urzi
Vodilna institucija: UP FAMNIT
Financer projekta: Rektorjev sklad UP
Raziskovalno področje (ARIS): 1.05 – Biokemija in molekularna biologija
Vrsta projekta: UP Podoktorske pozicije; znanstveno-raziskovalni projekt
Trajanje projekta: 1.10.2024 - 30.9.2026
Vstopamo v obdobje hitrega razvoja vrhunske tehnologije. Razvoj se je začel z masovno transkriptomiko, nadaljeval z epigenomiko, transkriptomiko posamezne celice, multiomiko in zdaj z epitranskriptomiko. Krožne RNK (circRNA) so fascinanten in nov razred RNK z edinstvenimi strukturnimi in funkcionalnimi lastnostmi, ki so ključni predmet epitranskriptomike. Njihova vloga in funkcija sta se šele začeli raziskovati, kar odpira široko polje novih raziskav.
S projektom želimo raziskati epitranskripcijske vplive na izgubo mišične mase in moči pri starejših odraslih. Z analizo krožne RNA (circRNA) v mišičnem tkivu oseb z normalno in zmanjšano mišično maso se želimo osredotočiti na regulatorne vidike teh molekul. Raziskava predstavlja nadgradnjo prejšnjih študij raziskovalke na področju epigenomike (snATAC-seq) in transkriptomike (snRNA-seq) v mišičnem tkivu.
Cilji projekta vključujejo karakterizacijo profilov circRNA z identifikacijo in kvantifikacijo circRNA v mišičnem tkivu. Dodatno bo raziskana povezava interakcij circRNA s podatki iz snATAC-seq in snRNA-seq in s tem integracija funkcionalne vloge circRNA v mišični biologiji.
Metodologija obsega izolacijo RNA, pripravo knjižnice za sekvenciranje, bioinformatično analizo podatkov in eksperimentalno validacijo ključnih ugotovitev. Projekt bo izboljšal razumevanje regulativnih mehanizmov circRNA, kar bo imelo potencialne klinične aplikacije pri zdravljenju mišičnih bolezni. Raziskovalka bo pridobila napredna znanja na področju sekvenciranja RNA in bioinformatike, kar bo okrepilo njeno raziskovalno kariero.
Oddelek UP FAMNIT, v okviru katerega se izvaja projekt:
Oddelek za biodiverziteto
Project presentationna vrh
Title: Epitranscriptional influences on muscle mass and strength: Exploring circular RNA in muscle tissue of older adults
Acronym: circExplore
Principal investigator: Felicita Urzi
Leading institution: UP FAMNIT
Funding organization: Rector's Fund UP
Research field (ARIS): 1.05 - Biochemistry and molecular biology
Vrsta projekta: UP Postdoctoral positions; scientific research project
Duration: 1.10.2024 - 30.9.2026
We are entering a period of rapid development in cutting-edge technology. This advancement began with mass transcriptomics, followed by epigenomics, single-cell transcriptomics, multiomics, and now epitranscriptomics. Circular RNAs (circRNAs) are a fascinating and novel class of RNA with unique structural and functional properties that are a key focus of epitranscriptomics. Their roles and functions are only just beginning to be explored, opening a broad field for new research.
This project aims to investigate the epitranscriptional influences on muscle mass and strength loss in older adults. By analyzing circular RNA (circRNA) in muscle tissue from individuals with normal and reduced muscle mass, we seek to focus on the regulatory aspects of these molecules. The study builds on previous research by the researcher in the fields of epigenomics (snATAC-seq) and transcriptomics (snRNA-seq) in muscle tissue.
The project goals include characterizing circRNA profiles by identifying and quantifying circRNAs in muscle tissue. Additionally, we will investigate the interaction of circRNAs with data from snATAC-seq and snRNA-seq to integrate the functional role of circRNAs in muscle biology.
The methodology involves RNA isolation, library preparation for sequencing, bioinformatic data analysis, and experimental validation of key findings. This project will enhance the understanding of circRNA regulatory mechanisms, with potential clinical applications for treating muscle-related diseases. The researcher will gain advanced skills in RNA sequencing and bioinformatics, which will strengthen her research career.
Department of Biodiversity
