Razvoj računalniških algoritmov za simulacije molekulske dinamike makromolekul
natisni
Naslov projekta:
Vodja projekta:
Nosilna institucija v Sloveniji:
Partnerska institucija:
Financer projekta:
Vrsta projekta:
Raziskovalno področje (ARRS):
Trajanje projekta:
Oddelek UP FAMNIT, v okviru katerega se izvaja projekt:
Razvoj računalniških algoritmov za simulacije molekulske dinamike makromolekul
UP FAMNIT
Javna agencija RS za raziskovalno dejavnost (ARRS)
Znanstveno-raziskovalno sodelovanje med RS in ZDA
1.07 - Računalniško intenzivne metode in aplikacije
1.7.2022 - 30.6.2024
Predstavitev projekta:
Cilj predlaganega raziskovalnega projekta je povečanje natančnosti in učinkovitosti obstoječih algoritmov za simulacije molekulske dinamike makromolekularnih sistemov. Nameravamo izpeljati nove metodološke rešitve za napovedovanje in preučevanje proteinskih vezavnih mest, ki temeljijo na pristopih teorije grafov, matematične kemije, v povezavi z metodami za simulacijo molekulske dinamike. Eden izmed ciljev projekta je združitev spletnega strežnika ProBiS z metodami molekulske dinamike v novo spletno orodje, ProBiS-ATLAS: Atlas proteinskih interakcij za napovedovanje genskih variacij, povezanih z interakcijami z zdravili in razvojem bolezni. Novo spletno orodje bo združevalo dve med seboj zelo različni področji, to je teorijo grafov in molekulsko dinamiko, ki sta naši glavni raziskovalni temi že vrsto let.
Oddelek za aplikativno naravoslovje
